AKSANSI Daerah merupakan representasi Sekretariat AKSANSI yang ada di tingkat Provinsi dan Kota/Kabupaten. Sebagai representasi, AKSANSI Daerah memegang peranan yang sangat penting sebagai ujung tombak pelaksanaan program-program AKSANSI di kota/kabupatennya. AKSANSI juga mempunyai peran untuk berkoordinasi dengan pemerintah daerah sehingga semua program-program sanitasi bisa berjalan dengan sinergis.
Sampai bulan September 2014 ini tercatat di level provinsi ada 6 yaitu di Provinsi Bali, Jawa Tengah, DIY, NTB, Sulawesi Selatan, dan Sulawesi Tenggara. Sedangkan di level Kota/Kabupaten terdapat 19 AKSANSI Daerah yang ada di:
1. Kota Surakarta
2. Kabupaten Temanggung
3. Kota Pekalongan
4. Kota Mojokerto
5. Kabupaten Sleman
6. Kabupaten Barru
7. Kota Parepare
8. Kabupaten Pinrang
9. Kabupaten Takalar
10. Kabupaten Soppeng
11. Kota Bogor
12. Kabupaten Kulonprogo
13. Kabupaten Tangerang
14. Kabupaten Jeneponto
15. Kabupaten Bantaeng
16. Kabupaten Bulukumba
17. Kota Makassar
18. Kabupaten Sidrap
19. Kabupaten Bandung
Dengan semakin bertambahnya jumlah AKSANSI Daerah ini, diharapkan akan semakin memperluas layanan AKSANSI untuk membantu sesama KSM didalam mengatasi permasalahan-permasalahan operasional dan pemeliharaannya sehingga bisa mewujudkan kondisi sanitasi yang layak dan berkelanjutan.